Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Cited2O35740 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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