Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms