Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms