Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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