Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms