Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ODF3BA8MYP8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms