Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palm3A2TJV2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palm3A2TJV2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palm3A2TJV2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palm3A2TJV2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms