Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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