Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sema6cQ9WTM3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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