Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms