Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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