Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms