Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed11Q9D2R4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms