Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trmt44Q9D2Q2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms