Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcf1Q9CTH6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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