Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms