Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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