Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csmd1Q923L3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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