Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Impg1Q8R1W8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Impg1Q8R1W8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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