Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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