Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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