Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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