Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms