Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms