Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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