Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6aQ78XR0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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