Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Jmjd1cQ69ZK6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Jmjd1cQ69ZK6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Jmjd1cQ69ZK6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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