Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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