Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms