Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctf1Q60753 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms