Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc9Q3V038 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ttc9Q3V038 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms