Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf180Q3U827 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf180Q3U827 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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