Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms