Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Spatc1Q148B6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms