Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms