Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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