Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms