Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms