Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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