Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ascl1Q02067 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms