Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top2aQ01320 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms