Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms