Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabpaQ00422 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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