Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms