Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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