Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms