Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms