Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CartptP56388 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CartptP56388 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CartptP56388 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CartptP56388 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CartptP56388 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CartptP56388 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CartptP56388 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CartptP56388 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CartptP56388 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CartptP56388 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CartptP56388 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CartptP56388 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CartptP56388 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CartptP56388 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CartptP56388 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CartptP56388 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CartptP56388 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms