Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms