Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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